金澤21世紀美術館的建築特色相當明顯而罕見，就是呈現正圓形的平面配置圖（少有美術館做此平面配置，就算紐約古根漢博物館也不是完全的正圓形），在美術館的館方標誌上，也能看到這個平面圖。這個正圓形的基地面積直徑有112.5公尺，沒有前方和後方的差別。
從平面上我們看到在一個巨大的圓中 , 有著許多大小不同的正方形和長方形並列
,然而從側面可以看到那些面積和高度比例各不相同的是展示室 ,
這些都是自然採光。根據各種作品的個性將他們安排在相應的空間裏。觀眾可以通過展示空間的變化充份享受到美術作品的活力。有 6
間珍藏品展示室 , 共 763 時平方公尺
, 高度為4-11.9m 。而特別展示室有 8
間 , 共1293平方公尺
, 高度為 3.7-11.9m。與美術館本館毗鄰的研究工作室
, 是同時具備鑒賞和創造功能的藝術家製作室式的空間 , 包括有聲作業在內允許
24 小時工作 , 可以使用水、火等 ,
具備藝術家長時間製作的環境。
另外美術館不高，有地下一層和地上兩層，在圓形基地的空間中，除了展區之外，還有圖書館、教室和兒童空間。特別的是展區並沒有集中在中心或外部，而是錯落的分散在基地裡，並有上下的差別。高處的展室能有玻璃天窗的自然採光，低處的展室則有外圍玻璃牆的採光，白天時，整個博物館的日照都非常平均。
1458平方公尺的市民畫廊 , 是日本引以為豪的最大的畫廊。作為市民創作活動的發表和鑒賞場所 , 有繪畫、雕刻、工藝、書法、攝影、影像和插花等廣泛的作品展示 , 然而這個空間被設計在地下一層。「劇場21」作為藝術交流活動的場所 , 不僅用於演劇、音樂會、表演、演講會及專題研討會之外 , 還能放映新的影像和舞臺藝術作品 , 其實是可以用於多種功能的大廳。設計長廊是一個不僅通過藝術 , 更是把多種價值觀的設計通過節目展現給市民們的場所。這裏不只是展示作品 , 更多的是以能成為地域產業活性的場所為目標 , 和地方上的企業一起舉辦各種表慎活動 , 同時又能作為一個為商品企劃和流通途徑的開發提供資訊交流的場所並加以利用。
美術館還考慮到兒童的舞臺 , 即父母和孩子或兒童們一起輕鬆走近的遊樂空間。此外 , 這裏還展示以孩子為主體的作品 , 以及各種藝術體驗節目。通過展覽會和時令話題的研究會 , 培養孩子們的豐富情操。
在藝術圖書館裏 , 能夠閱讀到以美術為中心的各種專業書籍 , 以及建築、時尚、音樂、設計、舞蹈、攝影、電影方面的資料等。無論是圖書館的外牆還是連接走廊的內牆, 都採用了通透的玻璃材料 , 這也體現了設計者認為資訊透明性的原則。
特別的展室
此美術館中有幾個值得一題的展室與作品，詮釋了空間就是藝術的一部份。其中最引人注目的是藝術家 Leandro Erlich 的作品《泳池》﹙The Swimming Pool﹚，其利用美術館的天窗加上一層水，並加上假的泳池扶手，從上看恍若真的游泳池，但遊客亦能在底下的展室走動，上下觀看，造成了特殊的趣味和效果。
